Il museo è organizzato in spazi
funzionali.
• Spazio espositivo permanente: sezione archeologica, sezione
scienze della terra e sezione scienze della vita.
• Spazio espositivo temporaneo: sezione mostre Sala
conferenze: disponibile anche per affitto a terzi.
• Centro di documentazione.
• Tre laboratori didattici, di cui uno strutturato come aula
per scavi archeologico, archeologico antropologico e
paleontologico.
• Due depositi archeologici: uno per il materiale
inventariato, catalogato e in fase di studio (a disposizione di
scuole ed utenti su richiesta), uno generale.
• Due depositi naturalistici: uno per il materiale
inventariato, catalogato e in fase di studio (a disposizione di
scuole ed utenti su richiesta), uno generale.
• Un mini laboratorio scientifico.
• Un'officina tecnica interna per la normale
manutenzione.
• Un osservatorio astronomico.
• Un'aula studio.